作為重組的一部分，南方司令部於2008年成立了安全和情報處，從此取代了J2情報、監視和偵察處，其組織結構如圖6.8所示。它的使命是「與戰區、成員、國家的、跨部門的和夥伴國家組織完全同步和整合，執行全源的、多學科的情報行動」。其職責還「使高層領導人完全了解相關信息並強化其決策，使戰區和地區作戰計劃和行動能夠改變環境和實施ISR（包括敏感偵察）行動，從而支持美國ｈｔtｐs://rｅａd•99csw•ｃoｍ南方司令官的工作重點」。2014年南方司令部的司令官確認，重點工作是在關塔那摩「一直持續的人道主義和有尊嚴的拘禁行動」，打擊跨國有組織犯罪，建設夥伴能力和應急計劃。南方司令部針對這些重點工作所開展的情報活動，包括：為財政部反威脅金融分支機構提供分析支持；與聯合簡易爆炸裝置對抗組織一起合作打擊哥倫比亞革命武裝力量（Reｈｔｔｐs://rｅａd•９9ｃsｗ.ｃoｍvolutionary Armed Forces of Columbia）和其他恐怖組織使用的簡易爆炸裝置；支持針對販毒集團和恐怖組織的特別行動；分析司令部職責區域內國家的政治發展。

自1946年作為加勒比司令部成立以來，美國南方司令部（SOUTHCOM）一直負責美國在中美洲和南美洲的軍事活動。1995年對聯合司令部結構的評估，使得美國南方司令部接替了美國大西洋司令部在墨西哥灣、加勒比海及其中的國家和地區、中美洲和南美洲周邊水域的職責。隨著北方司令部的建立，其分擔了墨西九_九_藏_書哥和部分加勒比地區的職責。如今，除了古巴，南方司令部的指揮管轄區域包含了31個國家和15個特殊任務地區，它們分佈於墨西哥以南的整個拉丁美洲大陸、中美洲和南美洲的附近水域得以及加勒比、墨西哥灣和部分大西洋區域。

南方司令部的成員司令部包括美國陸軍南方部隊（得克薩斯州薩姆休斯頓堡）、第12空軍（亞利桑那州戴維斯-蒙森空軍基地）、美國海軍南方司令部（佛羅里達州梅港海軍基地）、美國海軍陸戰隊南方部reａd.９9ｃsw.cｏｍ隊（佛羅里達州的邁阿密）。第5個成員司令部是美國南方特種作戰司令部，位於佛羅里達州邁阿密附近的霍姆斯特德空軍儲備基地。有3個特遣部隊在其指揮下行動：布拉沃聯合特遣部隊（宏都拉斯的索托卡諾空軍基地）、關塔那摩聯合特遣部隊（古巴關塔那摩灣美國海軍場站）和南方聯合跨部門特遣部隊（佛羅里達州基韋斯特）。它們的職能分別包括：運行一個具備全天候日/夜空中運輸能力的空軍基地：實施拘禁和審訊行動：實施反毒品行動。