得知消息，龍雲立即拍電報給在美國的四兒子龍繩文，電文就一句話：「盧漢10日轉變了！」欣喜之情，溢於言表。

名為軍參院長，實為軟禁。龍雲不忘反蔣復讎，他還把希望寄托在盧漢身上。可自從他離滇以後，蔣介石對雲南強力控制，繼任省主席盧漢過去掌握十多萬雄兵，現在連省政府衛隊的兵都是蔣介石的，談何為表哥龍雲東山再起？

案發後，在港英當局的嚴密搜捕下，葉翔之等再無機會對龍雲下手，直接離港去了台灣。葉翔之說：「龍雲運氣真好！」龍雲一生出生人死，這次又逃過一劫。

他最掛心的雲南，雖經連連催促，盧漢卻一直沒有動靜。到年底，有消息說,盧漢準備起義，但他要中共先給他一個指令，以表示是服從了中共。龍雲急得連拍大腿，說：「盧永衡還是舊軍官的腦筋！要先拿委狀才能幹么？現在不是那個時代了，只要你幹了，人家會承認你的！」

到重慶后的龍雲最愛看對蔣介石的抨擊文章，時常九九藏書向人推薦中共《新華曰報》和新華社消息，並極力抬高蔣介石對手。一議論時局，做為國民黨高官的他卻每次必說：「此路走不通，去找毛澤東！」以此泄憤。

1949年8月13日，龍雲在香港與其他四十三人發表聯合聲明，嚴斥蔣介石集團背叛孫中山先生三民主義，投靠帝國主義，實行法西斯獨裁專制；表示擁護中共，號召有愛國心的國民黨員與蔣介石決裂。第二天，他滿面春風接見記者，答問中透露雲南起義在即。香港報紙立即以「龍雲策動雲南起義」的大字標題刊出。

龍雲離開雲南后，「民主堡壘」昆明失去庇護，軍警特務囂張橫行，接連發生「一二·一」慘案和李公朴、聞一多遇害血案；人們都說，如果龍雲不走，這些都不會發生。聽到這些消息，龍雲感慨傷神，他說：「一些文人，能這樣不畏強|暴，捨生取義，很是難得！」並託人問候李、聞家屬。

民國1949年12月9日夜，在中共建rｅａd.９9ｃｓw•ｃom國已兩個多月、國民黨敗局鐵定的情況下，觀望已久的的雲南省主席盧漢終於動手，他扣押在昆明的國民黨各路軍官和包括沈醉在內的特務頭目十餘人，在五華山瞭望台升起五星紅旗，宣布雲南起義，等待中共接收。

經雲南老部下繆雲台秘密奔走聯繫，曾在雲南和龍雲並肩抗日的美國空軍第十四航空隊原司令、現任飛虎隊航空公司總經理的陳納德對龍雲處境十分同情，答應幫助雲龍出逃。

此後龍雲根本不到軍事參議院就任，閉門獨處。軍參院高級將領來拜訪，他拒不接見不說，就是蔣介石來看他，他也不但不出院門迎接，而且連房門也不出；蔣介石找話寒暄幾句，無趣告辭，他也不挽留、相送。

龍雲又說：「我身體不好，願在重慶長期休養，關於軍參院長職，請另委賢能擔任。」蔣介石連聲說：「要不得，要不得！」

龍雲抑制滿腹怨氣，說：「我一生只有兩個長官，一個是唐繼堯，一個就是你。我在你領導九九藏書下服務很久了，自問對你、對國家、對地方都沒有什麼對不起的。改組地方政府，調換職務，這原是很普通的事情，但是採取不正常方式，而用這種非常手段，未免過分，這樣做，恐對國人留下不良影響。」 I

發現龍雲逃脫，蔣介石大罵憲兵司令張鎮是「飯桶」，數名直接負責監視龍雲的「飯桶」被槍決。

終於獲得自由之身的龍雲，經過一段時間的深居簡出，開始活躍起來。他對蔣介石政權危在旦夕感到大快人心，先後派妻子顧映秋、三子龍繩曾回昆明活動，策動盧漢反蔣起義。

抵達重慶，陳誠和蔣經國接機。蔣經國請宋子文轉告龍雲，當晚蔣介石宴請。龍雲還在憤憤之中，以身體疲乏為由推託。

龍雲住在淺水灣。為防國民黨的追蹤暗殺，他向港督府提出是來港「政治避難"，港督府即為他提供了警衛保護。

蔣介石心裏暗笑：我不用非常手段，能調得動你？不過分，你會服從我？但他連連解釋：「我的指示不是這樣的，這九_九_藏_書是杜聿明搞錯了，要處罰！」

好不容易解決了龍雲，蔣介石嚴密防備其脫離控制、鹹魚翻身。1948年秋，中共開始發動三大戰役，國民黨兵敗如山倒，蔣介石集團開始安排退路，龍雲的命運又到了轉折點上。這一年，趁到南京開會的雲南老部下來拜會，龍雲找到機會，對老部下說：「獨夫（指蔣介石）要解我去台灣！」一語說出，已失去自由整整三年的當年「雲南王」聲淚俱下。

1946年，民國首都從重慶遷回南京。龍雲結束了在重慶二百二十九天的單調無聊生活，被裹挾到南京。

蔣介石集團對龍雲再也沒有表面的溫情脈脈。9月中旬，毛人風部署葉翔之等數名特務潛人香港，任務就是暗殺龍雲。而在動手前一天，特務們的任務臨時調整，把槍口對準了在香港的陸軍大學前校長、前駐蘇大使楊傑。9月18日，楊傑被暗殺。

到達香港后，香港各大報紙對這位九死一生的傳奇人物來臨表示極大關注，于第二天刊出「龍將軍來港」的新九_九_藏_書聞。南京方面維護顏面，自欺欺人，於12日由中央社發布消息，說龍雲「因健康關係，須易地療養，已奉准病假二月，于本月八日由京飛廣州轉香港就醫」。

陳納德分文不取，精心安排，1948年12月8日，龍雲終於逃出南京，乘坐陳納德提供的專機飛抵廣州，並乘輪船于次日抵達香港！被軟禁三年兩個月零一天後，龍雲獲得了自由。

在南京他的生活待遇極好，但遭受監視和軟禁，心情苦悶。龍云為試探自己的自由度，提出到杭州觀潮，蔣介石找借口不允；女兒龍閏璧赴美留學，龍雲想到上海送行，居然也未如願。在龍雲住處南京中央路一百五十六號的隔壁和斜對門，都是特務耳目；而正對面，特務機關乾脆開設一個商鋪，日夜監視龍雲行動。

第二天，宋子文攜龍雲去見蔣介石。蔣介石終於如願將這個多年遊離自己控制之外的「雲南王」拉下馬來，把他的王國真正納入了自己的管治之中，心情大好。他對龍雲殷勤有加，話語中又假惺惺略示歉意。