黃巢建立大齊政權后，與之前一度戰無不勝、攻無不取的威風形象判若兩人，既沒有出台什麼改革措施，以穩定人心，也沒有及時出兵，乘勝追擊望風而逃的唐僖宗，也沒有消滅關中附近的禁軍，以致給了唐朝廷以難得的喘息機會。

這時候，天已經黑了，先入城的程宗楚、唐弘夫、王處存三路人馬爭功圖利心切，貿然進城后，誰都沒有想到要派兵去守城，而是生怕後面諸將都趕到后搶了功勞，既不派人向總指揮鄭畋報告，也不跟長安外圍其他各道人馬聯絡以結援兵，更不打算派兵追擊農民軍，而是連夜瘋狂地去搶戰利品。這一搶就亂了套，不光是搶官署的，連百姓家也遭了搶。

黃巢匆忙撤退後，城外的唐軍也搞不清城中的情況。唐京城四面諸軍行營副都統程宗楚率部先自延秋門進入，行軍司馬唐弘夫唯恐落後，也緊跟著貿然進入。隨後，義武節度使王處存率五千銳卒入城。

黃巢再次奪取長安后，痛定思痛，也極力想打開局面。中和元年（881年）六月，黃巢派王播圍攻興平（今屬陝西），擊敗了唐邠寧節度使朱玫。八月，黃巢再派李詳擊敗唐昭義節度使高潯，乘勝收復華州。十一月，農民軍將領孟楷、朱溫進軍富平（今陝西富平東北），唐邠、夏二軍大敗，各自退兵回歸本道。

王淑頗為私心，故意逗留不進，結果被楊復光斬首，軍隊也被兼并。楊復光又將忠武軍八千人分為八都，派遣牙將鹿宴弘、晉暉、王建、韓建、張造、李師泰、龐從等八人分別統率。這些人中後來有幾位聲名鵲起，成為五代史中的重要人物，王建就是後來稱帝的前蜀高祖。楊復光率領八都軍與朱溫作戰，朱溫敗走，經商州逃回關中。此時同州和華州已經被唐官軍所奪，黃巢便命朱溫不必進京，前去奪回同州，再任同州刺史。

之後，長安農民軍的軍需供應就更加困難了。黃巢的得力謀士費傳古出了個主意，讓黃巢派朱溫開闢一條山南交通線。朱溫率數千精兵，賓士千里，一舉拿下鄧州。有了鄧州作屏障，商、洛至蘭田關的運路便暢通了。如果再給朱溫增兵，或者由朱溫自行發展，逐步打通襄、荊大道，形勢可能會再生變化，但此時黃巢還無此遠慮，朱溫本人也未必有此雄心。

圍攻長安的各路唐軍，遭此挫敗，只得撤圍。黃巢軍聲勢更read.99csw.com盛。之後，黃巢惱恨長安百姓曾經幫助唐官軍，縱兵進行報復性地屠殺，稱之為「洗城」，長安城血流成河。

黃巢雖然攻進了長安，但農民軍所控制的地盤只限於長安四周。黃巢進長安后，糧草供應是農民軍最緊迫的問題。農民軍四處流動作戰，還不能控制漕運，河中（今山西永濟）的地位在這個時候就凸顯出來。為了調發兵糧，黃巢不斷派遣使者到河中督促糧運，使者前後竟然有數百人之多。河中吏民不堪忍受，苦不堪言。王重榮忍無可忍，對部眾說：「起初我屈節事賊，是想緩解軍府的急患，如今黃巢來調財不已，又要徵調士兵，我們早晚要死於他手，不如發兵抗拒黃巢。」「眾皆以為然」。於是將黃巢派來的使者全部處死，重新歸附唐朝。此時，距離王重榮主動投降黃巢不過十四天。

不過，黃巢進長安后立即傳檄諸道，收服藩鎮。在農民軍聲勢的威懾下，唐藩鎮中有十分之三四都投降大齊政權。黃巢一時更加志得意滿。他沒有意識到，這些藩鎮不過是各懷私心，不願意替唐朝廷出頭，暫時持觀望態度，降跟叛一樣，對他們來說不過是家常便飯，這些藩鎮實力雄厚，對農民軍的潛在威脅卻絲毫沒有減少。首先發難的是已經投降黃巢的河中留後王重榮。

此時，黃巢正露營長安城東灞上，得知唐軍正在城中大肆劫掠。他斷定進入長安的幾路人馬沒有統一指揮，且各自為戰，當機決定引兵反攻。第二天天明時，黃巢主力軍分頭從諸門回返長安，展開巷戰。唐軍事先沒有任何防備，而且經過一夜搶劫，每個官軍都收穫極豐，身上背滿了搶來的財物，重負難行，毫無還手之力，以致被殺者十之八九，幾乎是全軍覆沒。唐主帥程宗楚、唐弘夫也先後被農民軍殺死。只有王處存反應快，加上熟悉長安地形，收集少數殘兵敗將，狼狽逃出長安。

這已經不僅僅是黃巢的理想問題，而是有農民軍的特質決定的。農民軍長期習慣於流動作戰，這是唐末農民起義中獨特的戰略戰術，利於保存實力。黃巢起義軍正是在大規模的運動戰中，牽著唐軍疲於奔命，顧此失彼，使唐朝對洛陽、淮南、江南不能兼顧，才取得了攻佔長安的勝利。但是，流動作戰容易產生流寇主義思想，沒有建立穩固的根據地。即使https://read.99csw.com在其聲勢十分強大時，也往往是攻下一城，不久又丟棄，像東都洛陽這樣的經濟、軍事重地也不留一兵一卒駐守。這就使唐軍得以重新佔領被農民軍波及的地區，並逐漸收縮包圍圈。而農民軍到長安后，仍然未能鞏固。這樣，農民軍得不到充足的供給，後勤沒有保障。一些鄉紳富豪多入深山，「築柵自保，農事俱廢，長安城中斗米直三十緡」。到了後來，農民軍將士不得不以樹皮來充饑，甚至發生了吃人事件。在這樣的情況下，自然談不上有什麼戰鬥力。因此，當唐諸路大軍雲集長安，向農民軍發起總攻時，形勢便急轉直下，歷時三年的大齊政權也就很快崩潰了。

值得一提的是，農民軍完全是在不明唐軍的情況下因恐懼撤出長安城的，並非是黃巢事先胸有成竹，安排了「誘官軍入城，伺機反攻」的妙計。只不過，黃巢出城后不久，天便黑了下來，如果點火繼續趕路很容易被唐軍發現目標，於是黃巢就地安營紮寨，打算第二天天亮再走。想不到，這一停，局勢就完全起了變化，令人不得不感慨偶然性在歷史棋局中的神妙。

受到「光復長安」消息影響的，還有忠武軍節度使周岌。周岌原為唐朝廷任命，剛到許州上任，就遇到黃巢攻克長安。不幾天，黃巢傳檄到許州，周岌不敢強出頭，只好投降了黃巢。聽到唐官軍光復長安的消息后，周岌立即派人去請老監軍楊復光（曾經勸說王仙芝歸降、直接導致尚君長之死的那位監軍）。楊復光心向唐朝，一直不滿周岌投降。左右都勸他不要去：「周岌已投降黃巢，恐怕將不利於你，不可輕易前往。」楊復光回答說：「事已如此，義不圖全。」（《資治通鑒·卷二百五十四》）於是前往赴宴。去了才知道，原來周岌是想重新歸附唐朝。當晚，楊復光派其養子在驛館將黃巢使者殺死。

王處存祖上數代均為神策軍軍官。他父親一面當官，一面經商，這是當時神策軍官流行的做法。但王父卻善於經營，很快成為長安巨富。王處存成年後也能繼家聲，當上了節度使，成為家族中官職最高者。王處存聽說長安失守后，痛哭了好幾天。這其中自然有心痛王家在長安的巨額財富的因素在裏面。之後，王處存決定與農民軍不共戴天，所以，他在出師對抗黃巢的行動中特別九-九-藏-書積極，與其他藩鎮要麼投降黃巢、要麼坐山觀望的態度截然不同。當時僖宗還在逃難當中，王處存不等收到詔令，就主動派軍隊入援，調遣軍隊二千人走小道趕到興元，以護衛僖宗的車駕。

尚讓兵敗回長安后不久，便發生了尚書省大門題詩事件。尚讓怒不可遏，在長安大肆屠殺。整個長安籠罩在一片恐怖的氣氛中。加上城外唐軍大兵壓境，就連農民軍自己也感到氣氛緊張，壓抑得令人難受。

在這樣的情況下，黃巢非常擔心長安城內發生變故，農民軍受到裡應外合的夾攻。他現在才知道，皇帝的寶座並不是那麼好坐，長安的天子也不是那麼好當。他曾經嚮往的華麗的宮殿，在目前看來只是空落落的成片的屋子，令人恐懼而沒有安全感。

而黃巢本人當了皇帝后，開始了花天酒地的享樂生活，一頭扎進了後宮的溫柔鄉中，為爭相獻寵的宮女和宦官所包圍，與宮門外的世界完全隔絕。上行下效。農民軍將領們在得到高官厚祿后，也沉湎於紙醉金迷的生活，不思進取。尤其令人難以置信的是，黃巢也很快學會了唐朝皇帝的那一套，開始派宦官去當監軍。這是相當令農民軍將領寒心的一項新舉措。這些農民軍將領在外駐防，辛苦地拱衛長安，非但不能享受京城花天酒地的生活，還要遭到曾經稱兄道弟、親密相依的大齊皇帝的猜忌，背後始終跟著雙監視的眼睛，這是怎樣的感受，又是怎樣的難受！從某種程度上說，後來不少農民軍將領投降唐朝廷，多多少少跟宦官監軍有關。

中和元年（881年）四月，唐軍向長安推進。鄭畋坐鎮盩厔，命唐弘夫進軍渭北，王重榮駐守沙苑，王處存進居渭橋，拓跋思恭紮營武功，形成圍攻長安之態勢。

王重榮料到黃巢必然大舉來攻，一面積極備戰，一面主動與義武節度使王處存聯絡，要求連兵抗齊。

王重榮三兄弟皆入軍籍，父親是禁軍將領。乾符年間，王重榮任河中都虞候。廣明元年（880年）十一月，正值黃巢跨過長江，進兵中原之際，唐朝廷忙得焦頭爛額，疲於應付。王重榮趁機煽動軍士作亂，四亂搶劫，河中坊市被搶奪一空。並率軍包圍了節度使府，要求河中節度使李都交出大印。唐朝廷對此無能為力，只好順乎「民意」，任王重榮為河中留後，將河中節度使李都召回京師。自此，九九藏書王重榮完全控制了河中兵權。黃巢率軍攻克潼關后，王重榮主動派人向黃巢請降，於是被黃巢任命為河中節度使。

然而，摧毀舊勢力容易，要建立新秩序困難。黃巢軍雖然四處作戰，或勝或敗，但始終未能打開局面。他不知道建立根據地，因此農民軍的隊伍雖壯大發展，但給養困難。給養一困難，農民軍只能去劫掠，紀律很難維持。如此，他始終得不到民心，新秩序就無法建立起來。黃巢雖然稱帝，但「號令所行，不出同（今陝西大荔）、華（陝西華縣）」，基本上仍然局限於長安一隅之地。實際上，他這個大齊皇帝，充其量不過長安城的城主而已。

鄭畋乘勝傳檄天下藩鎮合兵推翻大齊黃巢政權。當時僖宗李儇逃入成都，詔令不通，諸鎮以為唐朝廷就此完了，因此大多坐山觀望局勢發展，收到鄭畋檄文後，諸鎮各懷目的，爭相發兵關中。夏綏節度使拓跋思恭也糾合夷、夏之兵，會合鄜延節度使李孝昌，結盟討伐義軍。代北監軍陳景思率沙陀酋長李友金及薩葛、安慶、吐谷渾諸部入關助陣。奉天鎮使齊克儉主動派人與鄭畋聯繫，要求效力。前夏綏節度使諸葛爽本已投降大齊，此時又自河陽奉表降唐。

因為已經是晚上，夜黑難辨，為了便於識別，王處存下令唐官軍通通用白布裹頭。許多長安坊市無賴之徒卻趁機渾水摸魚，也以白巾為號，混同唐軍，一起趁火打劫。長安城裡無比混亂，長安百姓再一次承受了巨大的苦難。這苦難，是難以名狀的，他們本來是歡天喜地地盼回了唐軍，卻想不到官軍無惡不作，跟農民軍沒有任何區別。當夜，唐軍大肆擄掠財帛，姦淫|婦女，亂不成軍。

顯然，在各種各樣莫名的壓力下，黃巢的日子十分不好過。中和元年（881年）四月初五黃昏時分，黃巢正一肚子惆悵，煩惱不堪。北苑突然有唐軍大聲叫喊，黃巢誤以為唐朝大軍趕到，驚惶失措，匆忙率軍從春明門出城，往東退走。城內其他農民軍得知皇帝逃跑后，紛紛就近從各門一擁而出。數十萬農民軍就此退出了長安，散布在灞上和南郊山野。長安頓時成了一座空城。

農民軍同州刺史王溥、華州刺史喬鈐、商州刺史宋岩聽說黃巢已經退出長安，均慌忙棄城而走，率部眾投奔鄧州朱溫。朱溫此時尚忠實于黃巢，對三人棄城而逃極為惱怒，將王溥、喬鈐斬首示眾九*九*藏*書，收編了他們的部隊，而將宋岩釋放，讓他率軍回商州。

長安城內的百姓聽說唐軍打回來了，爭相趕來歡迎慶賀，為唐官軍獻食敬酒，歡呼聲響成一片。有百姓還用瓦礫投擊尚在城中的黃巢散軍，也有百姓主動收拾箭頭供給唐官軍。由此可見黃巢在長安始終不得人心。

後來周岌得知黃巢重新佔領了長安，還是決定要力保唐朝。他與楊復光商議，決定先下手為強，剷除對許州威脅最大的鄧州朱溫。於是，由周岌鎮守許州，楊復光率領忠武軍三千人到蔡州，勸說雄踞蔡州的秦宗權（後於蔡州稱帝）一同舉兵討伐黃巢。秦宗權於是派遣其部將王淑率軍三千人隨從楊復光進擊鄧州。

唐軍收復長安不到一天，便遭受了重大挫折。但這「光復長安」消息卻傳了開去，由於時間的滯后性，引發出一連串的事來。

黃巢聽到王重榮殺掉己方使者的消息后，勃然大怒，派弟弟黃思鄴從華州發兵，得力部將朱溫從同州發兵，兩軍會合后，一齊進攻河中。然而，王重榮早有防備，出兵拒戰，大破黃思鄴和朱溫軍。剛好此時大齊的吏部尚書兼水陸轉運使張言押運四十多船糧食兵仗，停在風陵渡，也被王重榮趁勢截獲。張言無法向黃巢交差，只好隻身駕小舟往下游逃去。

朱溫沒有退路，經過激烈廝殺后，終於奪回了同州。但州境之內的沙苑卻是唐兩大節度使王處存、王重榮的大本營，有重兵駐守，朱溫時刻處於威脅之中。

長安城中的黃巢這才開始擔心。中和元年（881年）三月，黃巢派尚讓率眾五萬進攻鳳翔，打算打敗在鳳翔指揮唐軍的鄭畋以壯聲威。尚讓自恃農民軍一直戰無不勝，而對手鄭畋不過是一介書生，定然不諳軍事。然而，麻痹大意下，尚讓軍在龍尾陂中了埋伏，被唐軍大敗，農民軍損折過半。

王重榮一戰得勝后，聲勢大振。義武節度使王處存親自率部趕來支援。而驚魂未定的唐朝廷也開始了調度，以進行反擊。僖宗任命鳳翔節度使鄭畋為京城四面諸軍行營都統，相當於進攻長安的總指揮。鄭畋走馬上任后，立即任命涇原節度使程宗楚為副都統，前朔方節度使唐弘夫為行軍司馬。大批唐軍開始調動，向長安結集。

稍有風吹草動，從上到下，從黃巢到農民軍部將，便棄城逃走。這隻能說明，所謂的大齊政權還只是一個名號，從體繫上而言，是相當不穩固的。