由於地下設施分析中心在國防情報局分析處辦公，可以說，該中心屬於一個跨部門合作，並且得到國家情報總監的支持。在這個中心工作的人員，來自中央情報局、國防情報局（特別是來自科技處）、國防威脅降低局（Defense Threat Reduction Agency）、國家安全局、美國地質調查局（U.S.Geological Survey）和美國戰略司令部聯合情報行動中心（U.S.Strategic Command Joint Intelligence Operations Center）。另外，空軍技術應用中心（Air Force Technical Applications Center）可能也有人員在這個中心工作。該中心建立之初有20名工作人員，到2009年，已增至240名。

導彈與太空情報中心，位於靠近阿拉巴馬州亨茨維爾的紅石兵工廠，擁有數百名僱員。1956年6月，陸軍彈道導彈局（Army Ballistic Missile Agency）成立了特別安全辦公室（Special Security Office），負責向該局指揮官提供導彈和太空情報數據。為了分析這些數據，該辦公室特地成立了一個技術情報科（Technical Intelligence Division）。1958年3月，陸軍在紅石兵工廠的活動統一合併到「陸軍軍需導彈司令部」（Army Ordnance Missile Command）之後，技術情報科大約有50名人員重新安置到「負責導彈情報的助理參謀長辦公室」。陸軍軍需導彈司令部於1962年被「陸軍導彈司令部」（Army Missile Command）收編。而負責導彈情報的助理參謀長辦公室又被改編為導彈情報處，並於1970年9月成為了導彈情報局；1985年8月read.99csw.com1日再次被改編為美國陸軍導彈和太空情報中心，其職能和任務就是「撰寫編輯世界上所有地對空導彈、彈道導彈防禦系統（戰略和戰術）、反坦克制導導彈、反衛星導彈、定向能量武器和其他有關的太空計劃/系統和指揮、控制、通訊和計算機等相關的科技情報」。

地下設施分析中心成立於1997年，位於弗吉尼亞州的赫恩登，致力於「探測、識別、定性和評估敵方廢棄的地下設施或已封閉並深埋的目標」。這類目標包括司令部和指揮控制設施、人員安置中心、武器工廠和飛機與艦艇停泊場。該中心努力向國家政策制定者、武器開發專家以及關注地下設施性質或意圖摧毀它們的軍隊提供情報和相關數據。

醫學情報在制定作戰計劃，特別是針對環境和流行性疾病與美國實際大不相同的地區，尤其至關重要。武裝部隊醫學情報中心職能的一個重要部分，就是撰寫編輯保健和衛生、流行病學、環境因素、軍事與民間醫療保健能力等方面的一般性醫學情報，諸如《醫學能力研究：朝鮮民主主義人民共和國》《亞洲——印度尼西亞地震和海嘯造成的健康影響》《歐洲毒蛇》等通過中心所屬部門在內部發行。中心職能的另一個重要部分，是撰寫和製作所有與軍事有關的基礎和應用生物醫學方面的醫學科學和技術情報，包括生物學、化學、心理學和生物物理學方面的信息。武裝部隊醫學情報中心的報告《非電離電磁輻射——激光器的醫學效應》，體現的就是上述職能。該中心還負責對外國生物醫學研發|情況以及它對醫療部隊生理效應的影響進行評估，並針對外國醫用材料的使用進行評估，這些外國醫用材料是根據國防部「外國材料使用計劃」採購的。

分析處是由「分析和情報編製處」（Directorate for Analysis and Production）與「政策支持處」（Directorate for Poliｒｅaｄ•9９cｓｗ•comcy Support）的大多數部門合併而成。分析處的一個重要關注點就是信息戰，長期致力於計算機和控制論戰、電子戰、心理行動、謀略欺詐以及信息系統的物理銷毀的研究。聯合作戰行動支持是分析處的另一個工作重點，根據行動環境、地理空間分析、否認與欺詐行動，以及戰俘/戰爭失蹤人員事務等等，提供所有來源的情報。

1982年，陸軍「醫學情報與信息局」（Medical Intelligence and Information Agency），專門負責向整個國防系統提供醫學方面的情報信息，被整編為「武裝部隊醫學情報中心」（Armed Force Medical Intelligence Center）。這個中心的成立可能源於對陸軍醫學情報與信息局的表現極大不滿。1981年，國防部審計局人員和國防情報總體計劃參謀部的負責人多次討論表明，美國情報界對缺乏西南亞和第三世界國家醫學方面的準確情報極為關注，「非常見疾病和環境狀況造成的傷亡可能在這些地方發生」。

毒品走私也是分析處工作的重要組成部分，撰寫編輯《可卡因動向跨部門評估》（Interagency Assessment of Cocaine Movement）。分析處還安排5名分析人員協助哥倫比亞實施反毒行動。分析處在與聯邦調查局共同合作「統治紀錄」（DOMINANT CHRONICLE）行動期間，翻譯使用了超過16萬份文件。該部門還向東南亞和西南亞地區的反毒行動提供情報支持。

分析處的一項主要職能是撰寫編製有關外軍軍事力量的各類情報，包括人數、駐地、現有地面作戰能力、海軍和空軍武器系統；武器研發力量和狀況、指揮、控制與通訊系統和設施；軍規條律、軍事演習；外國軍事領導人的傳記。

從2005年秋開始，武裝部隊醫學情報中心的https://read.99csw.com活動，包括為《總統每日簡報》撰寫編輯了9篇文章和每周形勢報告，供行動部隊和決策者進行禽流感的風險評估。另外，中心還向北方司令部的颶風「卡特里娜」聯合特混部隊，以及2008年「納爾吉斯」颶風重創緬甸后成立的聯合特混部隊提供支援。中心的分析專家也就伊拉克戰場上氯增強型簡易爆炸裝置所造成的威脅進行評估。

分析處其他工作人員分散在位於阿拉巴馬州、馬里蘭州和弗吉尼亞州三個中心辦公：導彈和太空情報中心（Missile and Space Intelligence Center）、國家醫學情報中心（National Center for Medical Intelligence）和地下設施分析中心（Underground Facility Analysis Center）。

2008年1月，國防情報局長在一份備忘錄中，請求將武裝部隊醫學情報中心更名為國家醫學情報中心，因為「武裝部隊醫學情報中心，事實上，已是國家級的情報中心」。備忘錄指出，「武裝部隊醫學情報中心是美國政府醫學情報的主要製作者，提供有關傳染病風險、軍方和民間醫療系統、環境健康風險、醫療科學和技術等方面的完整醫學情報成品，並且與國內其他情報機構建立了合作關係」。國防情報局長還指出，此舉與國防部成立「國家航空航天情報中心」（National Air and Space Intelligence Center）、「國家媒體開發利用中心」（National Media Exploitation Center）和「國家地面情報中心」（National Ground Intelligence Center）的舉措是一致的。

2009年，國防部關於國家醫學情報中心的指令，將中心的業務描述為「國防部醫學情報的主要活動」，規定，hｔtpｓ://ｒeａd.９9ｃｓｗ•cｏm「中心將準備並協調整合所有來源的情報，向國防部和政府其他部門以及國際機構提供外國健康和其他醫學相關的情報信息，以保護美國在世界各地的利益」。新名稱及國防部令的描述，反映了該中心授權承擔更多的職能，特別明確了中心在國土安全公共健康防護方面的使命。2006年，國防部長指令國家醫學情報中心增加額外責任和職能，就外國人健康對國土安全的威脅進行評估，並開始擴大與其他情報機構的聯繫。

眾議院特別情報委員會提交1991年報告《1992財年情報授權法年度預算》（Intelligence Authorization Act, Fiscal Year 1992），強烈建議，「武裝部隊的醫學情報中心和軍隊的導彈與太空情報中心……應整體移交給國防情報局，並成為國防情報局指定的外勤研究部門」。1992年初，國防部情報局制定出將這些中心移交自己掌握控制的計劃，移交命令也已下達。

陸軍導彈和太空情報中心撰寫編輯完整成品情報，涉及地對空導彈、反坦克制導導彈、地面反衛星系統和短程彈道導彈的特點、性能和運行情況。該中心的分析人員就某種武器的有效性進行評估分析，它如何工作，它的致命性，怎樣才能破壞它。導彈和太空情報中心對地對空導彈極為關注，包括由單兵肩扛發射的導彈，以及可以在數百公里以外攻擊目標的遠程空中防禦系統。該中心還與一些公司和機構共同研究設計空中生存能力的設備。另外，中心投入相當大的精力，密切關注部署能夠攻擊衛星的導彈或定向能量武器的地面武器。能夠從數十英里到600英里範圍攻擊目標的短程彈道導彈是該中心研究的另一個重點。

分析處還投入相當大的精力進行反恐分析，為國防部情報界進行恐怖行動評估和研究。分析處建立並維護國防部的恐怖行動資料庫，包括20多萬份涉及恐怖威脅、組織、事件、設施和人員的情報信息。分析處針對每年數百hｔｔps://ｒｅａd.９９csｗ.ｃｏｍ次國防部演習和部署行動進行恐怖行動審查與評估，長期負責提供恐怖行動相關的任何跡象、預警和危機處理情報支持，以及向美國國家軍事指揮中心負責恐怖行動支持的部門派出工作人員。另外，分析處編寫製作每日《國防恐怖行動情報概要》（Defense Intelligence Terrorism Summary），「提供給高層決策者和指揮官、安全官員和戰略制定者，作為恐怖行動相關分析和威脅信息的主要來源」。

國家醫學情報中心總部位於馬里蘭州的德特里克堡，大約有150名僱員分屬四個部門。「傳染病科」（Infectious Disease Division）的使命是「了解每一個國家的每一種類型傳染病的風險」，包括禽流感、西尼羅病毒、炭疽、埃博拉和瘟疫。與其他科一樣，傳染病科撰寫編製《基線傳染病風險評估》，併發布警報和傳染病預測。「環境健康科」（Environmental Health Division）負責監測和評估全世界化學工業、材料和設施的風險，並撰寫編製《環境健康風險評估》。這個部門還製作放射危害地區模型。有些設施需要24小時監測。「全球健康系統科」（Global Health Systems Division）的職責包括了解每個國家的醫療能力以及供血質量。這個部門撰寫編製《醫療能力評估》。「科學與技術科」（Science and Technology Division）的職責是了解每個國家抵禦化學武器、放射性武器和核武器的醫療能力。國家醫學情報中心和武裝部隊醫學情報中心所屬部門撰寫編製的文件包括：《傳染病風險評估——阿富汗》（2005年）、《基線傳染病風險評估——海地》（2009年）、《世界範圍：新的2009年H1N1流感病毒對美國軍隊構成潛在威脅》（2009年）、《海地：大地震相關的健康風險和健康系統影響》（2010年）。