明亡之後，充軍雖然為清律所保留，但清朝充分吸取了明朝覆亡的教訓，禁止犯法逃兵混收入伍，影響士兵質量，加上清朝軍制與明朝截然不同，因此清朝的充軍與明朝已有本質不同，罪犯充軍並不編為軍戶，充軍只是一種更重的流刑。按照清律規定，充軍分為附近充軍（二千里）、近邊充軍（二千五百里）、邊遠充軍（三千里）、極遠充軍（四千里）、煙瘴充軍（四千里）五等，稱為「五軍」。充軍與傳統的流刑並沒有太大區別，只是極遠充軍和煙瘴充軍的距離遠於流三千里而已。

流刑在五刑制中處於降死一等重刑的地位，但是隨著人們活動範圍的擴大，交通條件的改善，流刑已越來越無法實現降死一等的目標，它與徒刑的懲治力度也過於接近，因此明代基本將流刑存而不用，而另創了兩種新的流放形式，即口外為民rｅａd•９９csw.ｃoｍ與充軍。

當時，有一個叫作「不應為」的罪名，也就是法律沒有規定，但官府認為不應該去做的事情。所謂「律令無條理，不可為者」。這個條文就厲害啦，世事千變萬化，任何法典都不可能窮盡各種可能性，但即使法律沒有對此行為治罪，只要官府從情理推斷不可為之，就可以判處刑罰。說白了，這不過是給「欲加之罪，何患無辭」貼上了法律的標籤。「不應為」罪名首見於《唐律疏議·雜律》，但其刑罰不高，最重不過杖八十，但在朱元璋重典治亂的「嚴打」期間，許多人因犯「不應為」罪卻被發配充軍。明朝還有一種法外充軍的情況是「為力士事」，一種解釋認為力士是指力氣特別大的人，統治者認為力氣大者好鬧事，有礙社會治安，故遣戍之。當然，這種說法是否正確還有待進一步研究。

充軍為明朝滅亡埋下了禍根。如此悲慘的軍戶生活，導致軍隊缺乏基本的作戰能力和士氣。屯兵制度的實施又給皇帝隨時以屯田為名剋扣軍餉大開方便之門，加上明朝重文輕武、文人帶軍，種種制度htｔｐs://ｒeａd•９９csw.cｏｍ上的弊端導致明朝的軍隊成為中國歷史上戰鬥力最低軍隊之一。曾讓蒙古鐵騎望風而逃的大明軍隊在明朝後期竟然如此不堪一擊，最後落得個皇帝自縊煤山，江山拱手他人的悲慘結局。

「口外為民」作為一種懲罰模式，大致在明中葉天順初年，它與明初洪武時期的「家遷化外」、永樂時期的「發北京為民」有明顯的淵源關係。對於「口外為民」的「口外」，一般集中在北直隸的隆慶州與保安州，均位於北邊內長城之外。個別罪重的，或從隆慶、保安二州逃亡的，也可能發往遼東的安樂、自在二州。對於犯人而言，口外的生活條件異常惡劣，而且環境與內地完全不同。同時，如果罪犯以往是朝廷官員，在處刑之前，還要革除官職。除了朝廷大赦天下，明令可以放回以外，口外為民的罪犯一般都要終老當地，不能返回，因此其懲罰力度還是比hｔtpｓ://ｒeaｄ•９9ｃｓｗ.coｍ較強的。但是，口外為民與傳統的流刑並沒有本質的不同，它還是將犯人發配到遠離鄉土的地方，只不過地點比較固定，在解決流刑降死一等的問題上並沒有實質的突破，因此，口外為民並沒有成為一種普遍實施的懲治方式。

明代充軍的廣泛適用與其屯兵制度有莫大關係。明初為了解決軍隊的供給問題，實行軍事屯田制度，自力更生，自給自足，不給中央造成負擔。屯兵制度的初衷是好的，當年朱元璋就曾自豪地宣稱「吾養兵百萬，要不費百姓一粒米」。但是，軍旅生涯卻異常悲慘，強制的軍事屯田，兵士世代不得脫籍，軍餉微薄，戰時做炮灰，平時做苦力，逃亡則採取連坐，強制親戚家人代替。這種職業有幾人願意為之呢？一時之間人們千方百計想出辦法逃避從軍的厄運。明成化年間，御史王衡曾指出「況人所畏當者莫過於軍，千方百計逃避苟免」。當時有人為了逃避兵役，甚至將手指剁掉，以身有殘疾之名逃避徵召。於是這又為充軍增加了一個新的條目——「為剁指事」，類似於今天的戰時自殘罪。為了逃避軍事徵召，自九_九_藏_書虐自殘，就要強迫你從軍，而且還要讓你承擔比一般兵士更為惡劣的軍役。為了解決兵源問題，充軍也就應運而生。大量的犯人都被發配從軍，不僅自身，甚至子孫後代都要永遠為大明王朝效力。

充軍的嚴厲性體現在哪呢？我們不妨從其適用對象分別說明。對於軍官而言，在充軍以後，官職被罷免，而且還要南北互調。一般軍人充軍，先要受杖刑一百，同樣也要南北對調，而且還要承擔更為艱苦的兵役。如果軍官軍人沒有建立軍功，那就要終老駐地。對於非軍事人員而言，充軍的嚴厲性就更為明顯了。除了「南人發北，北人發南」外，他們的職業也發生改變，無論是官員還是民人，身份都變為軍人，而且還要在衛所承擔比一般軍人更為苛重的軍役和勞役，其待遇也更為惡劣。有趣的是，這類充軍被稱為「恩軍」，畢竟是皇帝從輕發落，免死充軍嘛！因此他們也應感恩戴德，終身服役「以謝皇恩」。明初的軍犯甚至為永遠軍犯，不僅自己要終身服役，其子孫後代均要世代承擔兵役。

流刑的另一種變異形式是充軍，也就是將罪犯發充軍役。嚴格說來，早在九*九*藏*書秦漢就有充軍的先例，但是作為一種普遍的刑罰形式，充軍還是在明朝被廣泛運用，清代繼續採用充軍之名，直到清末宣統時才被廢止。

在明初，充軍主要是針對軍人。軍人犯罪，若應處普通流刑，一般以充軍代替。受刑人終身要在邊境附近的軍屯服役。但是到了洪武中期，充軍開始適用於普通民眾。當時的法律規定：對非法鹽商、市場囤積居奇者、訟棍、無籍流民等其他一些沒有正當職業的非軍事人員都可以發配充軍。一時充軍人數急劇增加，以致「良民多坐微眚隸斥籍」，「故遣戍獨多，每一州縣無不以千數計」。相當多的老百姓被發配充軍，用來增強邊境禦敵的實力。充軍比傳統的流刑以及「口外為民」更為嚴厲，因此被普遍適用。在洪武初年，還只是偶有充軍記載，但到嘉靖、萬曆兩朝，適用充軍的罪名條款就分別增為213款和243款。除卻法律規定的條款，有相當的犯人還被法外加刑，發配充軍。