此後的北元皇朝仍然在與元王朝傳承同出一轍的不斷爭位內訌、與明王朝互相的對峙中延續了下去。從北元昭宗1371年稱帝算起，後來的北元先後傳了二十二任汗，計二百六十五年，直到最終歸服清王朝。

當天晚上，元順帝留下准王貼木爾不花「監國」，自己則帶著奇氏等后妃、皇太子以及多數朝臣奔出建德門，趁著夜色過居庸關直奔北方茫茫草原上的上都開平。

流亡宮廷在上都只呆了不到一年，常遇春、李文忠就帶著明軍追到，元順帝只得又奔往應昌（赤峰市克什克騰旗）。

元順帝與奇氏在上都也沒能過幾天安生日子。此後的日子里他們始終在游移中過活。

在大漠風沙相伴中進行一場戰鬥之後，明軍取得了勝利。除了脫古思貼木兒及其太子天保奴、丞相失列門等數十騎之外，其餘宗王嬪妃公主大臣軍戶近八萬人都當了俘ｒｅａｄ.９９ｃｓw•coｍ虜。

元王朝除了政權更迭雜亂無章內鬥頻仍這個大毛病之外，還有一個致命的問題：初期的統治者只知馬上得天下，不知下馬治天下，到後期的那些帝王更是馬上馬下都摸不著邊，還人為地劃分了等級制度，民族矛盾難以調和。因此元王朝的統治從一開始就已經問題不斷、起義不斷。但是最大最全面的起義，則是在元順帝至正十一年（公元1351）爆發的。

元順帝逃得很是時候。八月二十日，徐達的軍隊便開進了大都，監國王爺貼木爾不花被處死，元王朝在中原的統治宣告終結。

四年後的九月，朱元璋派人送買的里八剌北歸。——在北歸的隊伍里，又有沒有奇氏呢？仍然是未知。這位曾經橫行一時的大皇后、夫家元王朝與娘家高麗王國的雙料攪家精，就這樣在在茫茫史海中消失了身影。

九-九-藏-書洪武二十一年（公元1388），明王朝派大將軍藍玉率十五萬大軍北上，一直深入腹地，在捕魚兒海（貝爾湖）尋獲北元王廷。

洪武十一年（公元1378）五月，北元昭宗愛猷識臘達里去世，脫古思貼木兒繼皇帝位，稱烏薩哈爾汗，以天元紀年，亦稱天元帝。他沒把明王朝的懷柔政策當回事，仍然與明王朝為敵。

明王朝的懷柔政策宣告全面終結。

明洪武三年（公元1370）5月，李文忠與趙庸率軍攻打應昌，快到目的地的時候，他們抓到了幾個北元騎兵，得知元王朝的末代皇帝妥歡貼睦爾已於四月二十八日去世了，死因是瘧疾。

元順帝得到戰報，立即在端明殿召集群臣，在一片哭叫勸諫的紛擾中，他做出了「絕不能重蹈北宋徽欽二帝覆轍」的決定，打算不戰先逃。

然而元順帝和他的后妃太子親信大臣們，似九-九-藏-書乎從來沒有把農民起義當成一回事，為了各自的小團體利益，他們一次又一次有意無意地給予了起義軍休整合併的機會，到後來更是軍心渙散，不戰自敗了。

向西逃逸的脫古思貼木兒沒有父親那麼好的運氣。在土剌河（今土拉河，位於蒙古烏蘭巴托以西）地方，他遭遇了元世祖忽必烈之弟阿里不哥的後裔也速迭兒。一百多年前，阿里不哥因為與忽必烈爭奪汗位失敗，不明不白地丟掉了性命，他的後人和支持者一直在不斷地尋仇，脫古思貼木兒此時遇上他當然沒有什麼好結果。被俘后，天元帝脫古思貼木兒被也速迭兒以弓弦絞死，太子天保奴等人同時被害。

同年閏七月二十八日，明軍在徐達的指揮下一路勢如破竹，幾乎沒有遇到象樣的抵抗，就一直打到了通州。而這時元王朝最後一支真正還有些戰鬥力的軍隊卻隨著擴廓貼木兒遠在太原九-九-藏-書，根本無法解救大都城裡的元順帝。

買的里八剌北返后，買的里八剌易名為「脫古思貼木兒」。

當年六月，被北元昭宗甩下的元廷后妃皇孫都被解至南京。明太祖朱元璋沒有舉行獻俘之禮，對被俘的元廷諸人採取懷柔政策。

同月，明軍攻克應昌。除皇太子愛猷識臘達里和幾十名左右隨從騎馬突圍之外，包括皇太孫買的里八剌在內的所有后妃、宗王、官員、將士都成了明軍的俘虜。同時流亡宮廷的璽印財物牛羊駝馬也都成了明軍的戰利品。

愛猷識臘達里突圍之後一直向北，直達蒙古汗國故都哈剌和林。1371年，他在這裏登上了皇帝之位，繼續使用元王朝的年號紀元，這個王朝被稱為「北元」，愛猷識臘達里稱必力克圖汗，年號宣光，是為北元昭宗。在這樣的局面下，愛猷識臘達里總算明白當初與擴廓貼木兒的內訌有多麼得不償失。此後他一直read.99csw.com以擴廓貼木兒為臂膀，維持著北元的局面。

朱元璋認為元末帝妥歡貼睦爾棄城出逃故里，是「知順天命」的舉動，給他加了一個「元順帝」的稱號。又封元皇太孫買的里八剌為「崇禮侯」，讓元順帝后妃穿本民族服裝晉見馬皇后，又在龍山給他們安排宅院居住。

洪武八年八月，北元王朝的擎天柱、擴廓貼木兒（即漢人王保保）病卒于合剌那海衙庭。

定居龍山的元朝後妃中是否有奇氏？那就不得而知了。

終於，在各路義軍中，朱元璋成為最後的贏家。在消滅整合了陳友諒張士誠等各路兵馬之後，朱元璋，這個奇異的不世出天才正式建立了明王朝，並於至正二十七年（公元1367）下令麾下大將徐達發動北伐。

也速迭兒終於完成了祖宗的心愿，得到了忽必烈後人的皇帝璽印，遂在和林自立為汗。他沒有使用元王朝的漢文國號紀年，北元的漢字國號紀年終結。