這支軍隊有種種毛病，但即便是作為敵人的劉秀，也承認赤眉軍有「三善」：「攻破城邑，周遍天下，本故妻婦無所改易，是一善也；立君能用宗室，是二善也；余賊立君，迫急皆持其首降，自以為功，諸卿獨完全以付朕，是三善也。」

赤眉軍此時士氣低落，糧食斷絕，無力再戰，遂決定投降，派出已經很有投降經驗的劉恭前往宜陽洽降。劉恭見到劉秀后，問：「劉盆子率百萬之眾投降，陛下將何以待之？」劉秀清楚地知道赤眉此時困窘，已經沒有討價還價的餘地，遂輕蔑地道：「待汝以不死耳！」

赤眉杜陵之戰起初很順利，逄安擊敗延岑與更始將領李寶的聯軍，李寶投降。然而投降的李寶卻暗地裡與延岑通信，讓他回戰，自己則裡應外合。延岑依約回軍挑戰，赤眉軍空營而出與之決戰，李寶趁機悉拔赤眉軍旗幟，樹起自己的旗號。

劉恭替更始皇帝報仇，殺死失信的謝祿，然後又一次把自己關到九_九_藏_書牢房裡，但光武帝赦免了他的死罪。

即便是這樣的屈辱，赤眉仍然只能選擇投降。劉盆子率樊崇、徐宣以下三十多位將軍大臣肉袒投降，將赤眉軍從劉玄那裡搶來的傳國璽綬、更始七尺寶劍及玉璧等物交給了劉秀。

劉秀得到崤底的捷報，大為欣喜，回書馮異道：「始雖垂翅回溪，終能奮翼澠池，可謂失之東隅，收之桑榆。方論功賞，以答大勛。」在創造成語之餘，他親率漢軍主力急進宜陽，堵住了東逃的赤眉殘部。

可是赤眉糟糕的戰略頭腦，使得他們所有的勝利都無法轉化為勝果。湖之戰的勝利，並未讓他們認識到漢軍正在集結重兵，堵截東歸之路的事實，他們既不休整，也不籌備給養，就這樣莽撞地闖入了劉秀設置好的圈套里。

光武帝對劉盆子還算厚道，賞賜甚重，任命他為趙王郎中。後來劉盆子莫名其妙地因病失明，又被賜予滎陽的均輸官地，建起一排門面，靠收租金ｈttｐs://ｒｅａd.99cｓｗ.ｃom養老。

赤眉軍兵甲堆積，與熊耳山齊高。十余萬赤眉降眾，到這時，才能吃得上飽飯。這支曾縱橫中原的無敵勁旅，就這樣因為自身的痼疾，覆沒了。

劉盆子這幫「君臣」，被每人賜田二頃，宅第一所，與妻子終老洛陽。

劉秀晚年厭惡言兵，皇太子問攻戰之事，他長嘆一口氣，仰望著星空，悠悠地道：「當年衛靈公向孔子問征戰，孔子不答。戰爭，不是你能駕馭的啊！」

這個咄咄逼人的傢伙，已經不再是那個隨和的田舍翁劉秀了。

然而事情並沒有就這麼了結。這年的夏天，勇猛難制的樊崇、逄安因意圖謀反的罪名被殺。

然而此時的長安已不是幾個月前的長安，各路割據勢力都把目光集中在這座落魄的名城上，赤眉軍已經很難舒舒服服地呆在城裡。

赤眉軍戰疲回營，見旗號皆變，部隊驚亂。延岑、李寶趁機揮軍猛擊，赤眉大敗，在川穀中踐踏而死者十余萬ｒｅad.99ｃｓｗ•cｏm，逄安僅帶著數千人回到長安。

劉秀頷首笑道：「你就是所謂鐵中錚錚，庸中佼佼了！」

次日，劉秀大陳兵馬于洛水，命劉盆子等君臣列觀，然後拿這位可憐的本家兄弟開涮：「自知當死不？」劉盆子回道：「罪當應死，猶幸上憐而赦之耳！」劉秀大笑，咱們宗室里，還真沒你這麼滑頭的傢伙。

起於漢中的延岑勢力，也經散關進駐杜陵，窺視長安。

涮完了劉盆子，劉秀又回過頭來涮樊崇：后不後悔投降？現在放你們回去，咱們再決一勝負？樊崇雖然戰敗投降，但終究是條漢子，這樣公然的侮辱讓他很難堪，然而他手裡已經沒有了武器，也只能閉口不答。徐宣叩頭道：「咱們一出長安東門就想投降的，只是沒來得及告訴手下人罷了……今日得以歸降陛下，猶如去虎口而歸慈母，歡喜得很，哪還會後悔啊！」

公元二十七年正月，赤眉軍與馮異軍會戰于崤底。馮異派精兵萬余，化裝成赤眉軍，在預計的九-九-藏-書戰場附近埋伏。然後向赤眉軍挑戰，故意示弱，引樊崇不斷投入預備隊。

樊崇派逄安率軍十萬前往杜陵，準備一舉消滅延岑。

當時，「三輔大飢，人相食，城郭皆空，白骨蔽野，遺民往往聚為營保，各堅壁清野」。赤眉軍後勤補給斷絕，向民間擄掠也無所得，於是歸鄉派佔了上風。樊崇等人引軍東歸，出發時尚有二十余萬人。

漢軍給養充足，以逸待勞，坐待赤眉軍撞上門來。然而赤眉確實是一支戰術上所向無敵的軍隊，即便已是強弩之末，仍然能夠在湖之戰中大敗鄧禹、馮異聯軍。

楊音在長安時，對劉秀的叔父劉良很照顧，因此被賜爵關內侯，與徐宣一塊回到東海的故鄉，老死於東漢朝初年的太平盛世。

劉秀此時已定都洛陽，赤眉軍的行動，無異於向這一中原最強大的軍事力量挑戰。劉秀針對赤眉的行動，派遣破奸將軍侯進屯駐新安，建威將軍耿屯駐宜陽，大司馬吳漢則率大軍集結于洛陽附近，加上馮異、鄧九_九_藏_書禹軍團，對赤眉形成了南北夾擊之勢。

最後，雙方形成僵持。按以往的經驗，赤眉軍更善於持久作戰，似乎樊崇贏定了。這時馮異的伏兵發揮了作用，赤眉軍正在苦撐之時，突然發現身邊出現大量自相殘殺的「自己人」，軍心頓時大亂。馮異抓住時機，全軍出擊，將赤眉軍徹底擊破，共俘降男女八萬餘人。樊崇等人突出重圍，不敢再戰，率殘部十余萬人向東南疾走。

佔據雲陽的鄧禹，獲悉赤眉主力離開長安，城中只剩下老弱殘兵的消息后，再次率軍攻入長安，與赤眉軍夜戰于蒿街（當時外國使節、商人及移民聚居處，有點像現在的東交民巷——不過那時候的洋鬼子可沒有治外法權，犯了罪比中國人罰得還重，不折不扣是「番邦蠻夷」的待遇。這裏也是向外國人炫耀武威的地方，大名鼎鼎的郅支單于，就曾被懸首於此，以宣揚大漢「犯我強漢者，雖遠必誅」的決心）。適逢謝祿回救，鄧禹軍再次大敗，劉秀遂以智勇雙全的馮異替換他。