王明、康生污衊陳獨秀為漢奸，陳對此耿耿於懷。1939年，因張國燾建議，蔣介石派胡宗南和戴笠去拜訪陳。但是當胡、戴要求陳公開攻擊延安時，陳卻不為所動：「本人孤陋寡聞，更不願公開發表言論，致引起喋喋不休之爭。」

陳獨秀的嗣父陳衍庶家大業大，卻於1909年，因為英國公司收購大豆，英國人違約而破產。二次革命失敗后，由於陳獨秀反對袁世凱，袁派人抄了陳家，從此陳家愈發衰敗。但作為家中唯一繼承人的陳獨秀卻對家事不聞不問。陳擔任中共中央局書記后，有人傳言他家擁萬貫。1925年秋，英國勞工運動的左翼領袖勃勞頓到上海，好奇地問陳獨秀，國內外報紙常說你「家擁巨資，確有是事乎」？陳邊笑邊指著隔壁房間所藏黨內外文件說：「吾之財產，全在乎此！」

抗戰爆發后，周佛海請陳獨秀加入國民九*九*藏*書黨政府設立的國防參議會，陳嚴辭拒絕道：「蔣介石殺了我許多同志，還殺了我兩個兒子，我和他不共戴天。現在大敵當前，國共二次合作，既然國家需要他合作抗日，我不反對他就是了。」

在上海，陳獨秀與章士釗一起辦《國民日日報》，兩人常常徹夜工作，到第二天凌晨才休息。章士釗回憶當時二人辛苦工作的情形道：「兩人蟄居昌壽里之偏樓，對掌辭筆，足不出戶，興居無節，頭面不洗，衣敝無以易，並也不浣。一日晨起，愚見其黑色袒衣，白物星星，密不可計。愚駭然曰：『仲甫，是何物耶？』獨秀徐徐自視，平然答曰：『虱耳。』其苦行類如此。」

1937年10月6日，陳獨秀在華中大學進行抗日演講。據上海《大公報》報道：傍晚，不到7點鐘，「華中大學的禮堂已經擠滿了青年群眾。大門https://read.99csw.com外站著兩個黑衣警察，執著槍，阻止一片黑壓壓的群眾進門。……台上和台下，到處都有人在密密地聚集著，連風也難透過」。陳獨秀「從猛烈的掌聲中，由華中大學學生抗敵工作團的同人陪伴著步上講台」，「群眾的狂熱使他微微有點興奮，枯乾的面色泛著紅。他老了，頭頂禿了半個，發已斑白，留著短須。……倔強的風骨隨時表露著，一件灰色袍子，失去了光的皮鞋，依然是寒士風度」。演講完畢，「六百個座位的禮堂里，三千隻手作了一度雷聲似的鼓掌」。

臨終前，陳獨秀留給妻子潘蘭珍的遺言是：「今後一切自主，生活務求自立，切不可拿我的名聲去賣錢。」

陳獨秀擅長寫舊體詩，且流傳甚廣，章士釗在五十年代見到周恩來時「偶及舊事」，周對陳的《存歿六絕句》，猶能朗誦不誤。但到1921九九藏書年，陳忽然不作詩了。很多人都感到奇怪，有人問李大釗，李解釋道：「仲甫生平為詩，意境本高，今乃『大匠旁觀，縮手袖間』，窺其用意，蓋欲專心致志於革命實踐，遂不免蟻視雕蟲小技耳。」

青年時期，陳獨秀曾自篆一印章，曰「女話小弟」。女話是屈原的姐姐。陳獨秀自譬屈原，可見其憂國憂民之情深。

年未弱冠的陳獨秀心懷天下，撰寫了《揚子江形勢論略》。文中，他對長江的自然地理、水文地理、軍事地理、經濟地理等方面進行了較為詳盡的分析論述，洋洋七千余言。為了引起國人注意，他還將這篇文章自費印刷出版。

1938年初，王文元建議陳獨秀去香港，以擺脫國民黨當局對他的監視。陳謝絕了，他說：「我們擁護與參加抗戰，就無論如何得留在抗戰地區，利用人家不得不給我們的合法身份來作公開的批評，如一去香九_九_藏_書港即表明自動放棄了這一身份。」

陳獨秀說：「你見過蝗蟲怎樣渡河嗎？第一個走下水邊，被水衝去了，於是第二個又來，於是第三個，於是第四個；到後來，他們的死骸堆積起來，成了一座橋，其餘的便過去了。那過去的人不是我們的真生命，那座橋才是我們的真生命，永遠的生命！因為過去的人連腳跡也不曾留下，只有這橋留下了永遠紀念的價值。」陳接著自況道：「此骨非饑寒所困，一身為人類之橋。」

「蘇報案」發生后，陳獨秀回到安慶創辦《安徽俗話報》，后又移至蕪湖。汪原放回憶，一位剪掉辮子披著頭髮的二十五歲的青年，背著包袱，拿著把雨傘，來到了科學圖書社。汪孟鄒對他說：「我這裏每天吃兩頓稀粥，清苦得很。」陳聽后平淡答道：「就吃兩頓稀粥好。」遂寄居在科學圖書社樓上，書一聯明志雲「推倒一時豪傑，擴拓萬古心胸」，雖臭九九藏書蟲布滿衣被，亦不自覺。

八國聯軍侵華，中國戰敗。陳獨秀至此方知世界上有國家，國與國之間「此疆彼界，各不相下」，而「一國的盛衰榮辱，全國的人都是一樣消受」，他亦無法逃脫。他「越思越想，悲從中來」。他覺得，「我們中國何以不如外國，要被外國欺負，此中必有緣故」，於是他決定到日本留學，去各國查看一番。

抗戰期間，陳獨秀表示，國難當頭，誰能領導這場戰爭，誰就是他擁護的對象。他表示：「此次抗日戰爭，無論是何人何黨所領導，任何人任何黨派都應該一致贊助。」

陳獨秀后被中共開除黨籍，但「九一八」事變發生后，陳對中共的態度發生了變化。他在1932年1月1日的《告全黨同志書》中，明確表示：「我們左派反對派在一切行動中都準備和全黨同志攜手前進！」並與彭述之、羅漢一起寫信給中共中央，提出「合作抗日」的建議。