不過在興兵討伐之前，家康還是決定要先對豐臣氏的現金儲備進行消耗，以免其在開戰時憑藉巨額黃金招募浪人與自己作戰。在關原之戰結束后，雖然家康已經將堺町、京都等商業繁華地帶以及全國礦山控制在了自己的手中，但大坂卻依然在全國的大米交易中佔據著主導地位。因此除65萬石封地所帶來的稅收以外，豐臣家依然坐擁大量經濟收入。《荷蘭東印度商會史》中便曾在1607年8月記載如下：「他（秀賴）現在年齡在十八歲左右，雖然還沒有統治天下的才能，不過卻有不菲的收入和（秀吉）留下的巨大財富。如果能有更多大名和百姓支持他的話，可以斷言，即使沒有過人的才華，他也能憑藉巨額的財富來獲取天下。」

下定決心剷除豐臣后，家康便開始哄騙淀姬，消耗豐臣家的財力。秀吉在世時，曾經在京都的方廣寺建造了一尊大佛像，但後來卻毀於地震。現在家康便以希望秀賴繼承太閣遺志為名，鼓動淀姬出資重修京都的一些寺院，並重鑄大坂方廣寺的大佛。身為女流之輩的淀姬非但沒有察覺家康的陰謀，反而對後者提及太閣遺志而報以好感，很快便將這一行動付諸實施，不過這一行動最終卻招致了豐臣的滅亡。

到當年冬季大坂圍攻戰開始時，幕府軍已經集中了19萬人的部隊，面對著豐臣氏召集起來的11萬人（其中大部分是靠現金雇傭的浪人，而這些人中又多為關原會戰後被德川家康剝奪領地的西軍武士）。在12月初對大坂城發動的幾次進攻失敗后，家康便開始在大坂城以南布置歐式火炮。到16日，家康已經部署了20門火炮。這些火炮不分晝夜地開始對大坂城進行射擊，對豐臣軍造成了極大震撼，其炮聲連京都都能清晰聽到。淀姬在震驚之下立刻同意了德川家康的停戰要求，自行填埋了大坂城外以及二之丸、三之丸的護城河，並拆毀了城牆外一切工事。

在初步確立了江戶幕府的統治之後，家康在1605年把將軍職位讓給了兒子德川秀忠，自己則移居駿府城，其目的也和豐臣秀吉將關白讓給秀次一樣，在於向世人宣告征夷大將軍一職自此由德川家世襲，實權則並未交給秀忠。與此同時，家康也開始尋找借口，試圖對大坂挑起戰事，以便將其徹底毀滅。

關原會戰結束后，雖然德川家康仍然保持著豐臣政權大老的名義，但豐臣政權的統治體系卻已經崩潰了，五大老之中有三人（毛利輝元、上杉景勝、宇喜多秀家）成為戰敗者，五奉行之中也有三人（石田三成、增田長盛、長束正家）受到處罰，秀吉臨終時建立的整個決策、執行體系已失去了繼續存在的可能。不過家康此時卻也不九*九*藏*書敢過於激化與豐臣秀賴這位自己名義上的主君的矛盾，因而在關原戰後只能和豐臣秀賴聯名發布命令執掌天下。

在秀忠繼任將軍的典禮開始之前，家康便要求秀賴前往京都進行參拜，宣告豐臣氏從屬於德川氏。秀賴之母淀姬對此勃然大怒，拒絕了家康的要求，甚至開始聯絡前田利長、福島正則等人，希望這些老臣能夠興兵討伐家康。但令淀姬意外的是，前田利長斷然拒絕了自己的請求，而福島正則也在安撫了淀姬一番之後便沒有進一步行動。

在此之前，豐臣秀吉以太政大臣兼任關白之職統轄日本，雖然關白一職並非武家官位，卻位極人臣，擁有代替天皇攝政的權力，因此秀吉對天下的執掌也合乎法理。不過在他將關白之位讓給養子豐臣秀次之後，雖然這位太閣仍然保有著天下實權，但頒布政令卻也必須與秀次聯名。秀次被處死後，雖然秀吉仍然保有太政大臣的官位，但這一官位自古以來便沒有實權，因此其對天下的控制便只能單純依靠武力和諸大名對他個人的忠誠。對豐臣政權而言致命的是，太政大臣並不像征夷大將軍或關白一樣可以世襲，因此政權的繼承依據在秀次被處死那一刻便終結了，而終結豐臣政權的事實上正是秀吉本人。

直到黑船來航前夕，幕府和各藩國才在外國越來越大的威脅下開始通過荷蘭或其他渠道緩慢地吸收了一些在西方已經過時的武器和戰術，但在面對歐美部隊時仍然不堪一擊。更重要的是，在西方國家從封建軍隊過渡到國家軍隊並採用統一兵役制的同時，日本國內仍然藩國林立，軍隊的效忠對象僅是藩國本身，無法形成一支以日本民族為精神核心的民族軍隊。

1611年，二條城建成后，家康再次要求秀賴上京參見自己，如果對方再像1605年那樣拒絕自己，將軍德川秀忠便可以以秀賴抗拒幕府命令為由對其進行討伐。不過此時已經明確了自身武家地位的豐臣秀賴也不敢拒絕家康，被迫選擇上京，而這一決定使家康暫時沒能獲得討伐豐臣家的借口。由於在此過程中，加藤清正、福島正則等豐臣系大名仍對秀賴的安危抱以擔心，福島甚至還在大坂屯兵保衛秀賴。再加上秀賴本人仍然保持著高傲的態度，這也使行將就木的家康再次堅定了要在生前剷除豐臣氏這一幕府毒瘤的決心。

由於日本在江戶時期處於普遍的和平狀態，因此武士雖然在身份上成為了職https://read.99csw.com業軍人，但事實上卻只是幕府或各藩的公務人員。與此同時，武士們也開始接受文治教育，並奉行儒學思想，逐漸形成了一套模糊但又十分系統的道德行為準則，這便是武士道的誕生。不過這套準則宣揚的忠君思想也導致了後來幕末時期希望天皇重掌朝政的尊皇思想盛行，成為了江戶幕府自掘的墳墓。從此時起，武士不再是單純的武夫，同時也成為了日本人口中接受最良好教育的知識分子，其中的佼佼者在未來還將承擔起改革日本國體，推翻武家封建政權的重任。

與此同時，為平息豐臣系大名的不滿，並利用豐臣氏鉗制幕府，朝廷在4月16日加封德川秀忠為將軍之前四天將豐臣秀賴晉陞為從一位右大臣。家康對朝廷的這一行為十分不滿，自鎌倉時代開始，武家的賞罰應先由幕府定奪，而後再申報朝廷宣布。朝廷擅自加封秀賴一事不僅違背了這一原則，而且如果任由此事發展，豐臣氏早晚便會以秀吉受賜豐臣姓躍升為皇族后便不再屬於武家的理由脫離幕府節制，成為獨立於江戶體系以外的一方諸侯，甚至動搖江戶幕府的基礎。

家康這一次雖然沒有強制要求秀賴上京參見秀忠，但卻在1606年4月26日向朝廷重申武家的官位必須由幕府定奪。豐臣秀賴為避免與幕府發生衝突，也被迫在次年1月辭去了朝廷授予的右大臣官位。1609年7月，朝廷內部發生了私通事件，幕府借處理此事件的機會插手朝廷事務，並逼迫與豐臣氏交好的后陽成天皇退位，終於將朝廷完全握在了自己的手裡。

日本的軍事制度雖然也發生了一定變化，不過總體而言仍是對織田信長兵農分離制度的繼承。在江戶幕府時期，足輕正式成為了武士，農民被徹底隔絕在了作戰部隊以外，僅能擔任挑夫、僕役等輔助人員，而不能參加正式戰鬥，在階級上完成了對軍隊和百姓的分離。全國人民則被分為士、農、工、商四個階級，理論上而言，四者互相之間不得更換身份。為加強對武士和農民的控制，幕府禁止武士隨意離開自己的藩國，而農民和其餘百姓也不能變換自己的耕地，甚至在江戶初期硬性規定農民不得種植大米以外的任何作物。不過由於後來大米價格下跌，各藩經濟幾乎崩潰，幕府只得放寬了這一限制。

在大名轉封結束后，家康便開始著手毀滅豐臣政權的經濟基礎。秀吉在世時，曾將全日本絕大部分金礦都控制在自己手中，並使大批金銀流入市場，使得京都、堺一帶的商業愈發繁榮起來，而他自己便以此基礎賺取大量稅收。關原會戰結束后，家康迅速取得了堺町的控制權，將其納入德九-九-藏-書川氏的直轄領。1601年5月，家康又在伏見設置掌管金銀鑄造的銀座以確保自己對於全國金礦、銀礦的控制。

不過到此時為止，出身豐臣氏家臣的大名對此雖然不敢反抗，但在義理上卻沒有義務將僅是豐臣家大老的德川家康視為主君。而其中福島正則、加藤清正二人則更是被視為豐臣秀賴的忠實維護者，一直反對著家康削弱豐臣氏的行動。不過這一情況在1603年2月12日家康被天皇冊封為征夷大將軍之後發生了逆轉。

大驚失色的淀姬和秀賴雖然百般解釋，但早已下定決心剿滅豐臣一族的家康對此根本沒有理會，並針鋒相對地提出了三個條件：要求秀賴前往江戶覲見將軍德川秀忠；將淀姬送往江戶作為人質；放棄大坂城接受幕府轉封。如果豐臣氏不接受便要集結大軍討伐大坂。自豐臣秀吉死後，淀姬始終掌握著豐臣家的權力。在家康提出三項條件后，淀姬立刻加以回絕，家康終於得到了夢寐以求的開戰口實。

在此之後，家康首先面臨的工作便是組建一個穩定的幕府體制，控制日本各地大名，阻止豐臣氏再興的可能。而在這三者之間，又以豐臣氏為德川天下最大的一個不穩定因素。德川家康在就任將軍時已經年逾70，如果自己不能在離世前徹底消滅豐臣家，在關原會戰後遭到處罰的大名們便有可能以光復豐臣政權為名掀起反旗。為在軍事上斷絕這一可能，家康在關原會戰後的大名轉封中便將自己家臣出身的大名安插在了中山道和東海道附近，牢牢將這兩條從大坂通往江戶的要道控制在了自己手中。此後家康又重建了在關原戰役期間被燒毀的伏見城，並將其建設得比之前更大，以此作為控制大坂的橋頭堡。另外，他還在京都天皇御所不遠處開始建造二條城，將其作為京都所司代的駐地，用以對天皇朝廷進行監視和控制。為消耗原豐臣系大名的實力，伏見城和二條城的建造主要便由這些大名承擔，家康還命令這些大名參与擴建江戶城、駿府城，幫助自己的譜代大名井伊家修建彥根城等工程。

有了對朝廷的控制權，家康終於可以隨意定奪豐臣氏的地位了。1609年12月8日，武家傳奏廣橋兼勝前往大坂賞賜薰物給豐臣秀賴。由於武家傳奏一職專門負責朝廷與武家之間的事務，因此這一行動也成為了朝廷確認豐臣氏屬於武家，而非公卿的宣告。這也就意味著，豐臣氏必須服從於幕府管轄。在這之後，家康便可以一心尋找借口來剷除豐臣家了。

家康並沒有就此放棄徹底消滅豐臣氏的打算。1615年3月，家康要求豐臣氏遣散手下軍隊，退出大坂城等待轉封。再一次遭到豐臣氏拒絕後，家康於4月6日向諸大名ｒead.99ｃｓｗ•coｍ發布命令，要求後者將軍隊重新集結在鳥羽、伏見地區，而秀忠也在10日率軍從江戶啟程前往近畿。到五月初時，幕府軍已經有15萬人集結在了近畿地區。雖然真田信繁等人在大阪城下進行了英勇的戰鬥，失去防禦工事的大坂城還是最終在5月7日陷落。秀賴和淀姬母子二人在一座糧倉中自殺，家康的孫女、秀賴的正室千姬則逃到了幕府軍中。曾一統日本的豐臣氏徹底毀滅，延續了超過一百年的戰國時代也在這一天徹底結束了。

親藩、譜代享有參与幕府決策的權力，其封地雖然往往是戰略要衝，但面積通常並不大，因而譜代大名自然而然地將自己的利益與幕府緊密聯繫在了一起，形成了以幕府為核心的德川家臣團。而外樣大名雖然封地面積較大，但卻被排除在了國政的決策層之外。此外，後來還逐漸出現了水戶、尾張、紀伊三個擁有將軍繼承資格的德川氏分支藩國，被稱為「御三家」。與鎌倉幕府的早期制度以及室町幕府極為鬆散的權力分配相比，江戶幕府對於全國的管制十分嚴格，而這也成為了其統治日本長達250年的權力基礎。

1600年12月19日，家康邁出了在政治上十分關鍵的一步，將公卿九條兼孝推上了關白之位，給予豐臣家致命一擊。在此之後，關白之位便重新由毫無實權的朝廷貴族接掌，而豐臣氏則被排除出了日本的政治核心，淪為了一個實力強大的普通大名。家康成為征夷大將軍並開設江戶幕府之後，德川氏和豐臣氏之間的地位完全被逆轉了。在就任將軍之前僅僅4天，家康還曾以豐臣氏大老的身份前往大坂對秀賴進行新年朝賀，但在那之後便從未再次拜見。不過為了安撫豐臣系出身的大名，家康也按照秀吉的遺言，將自己的孫女、德川秀忠的女兒千姬嫁給了秀賴，而且宣稱自己只是為秀賴代掌天下，待後者成年後便會將將軍之位讓出。

與此同時，由於武士已經不再征戰沙場，而成為了事實上的文職人員，因此雖然各藩國仍會對由下級武士組成的藩兵部隊進行訓練，但士兵的士氣和高級將領的指揮能力卻大幅下降。以致於到幕末時期，各藩軍事改革幾乎均由藩兵編製以外的下級武士推動。

江戶時代的幕府以幕藩體制統治全國，幕府為國家最高政權機構，征夷大將軍則為日本最高領導人。江戶時期日本各地設有260餘個藩國大名，藩國聽命於幕府，後者有權增加、減少各藩國的領地或對藩主進行賞罰，藩國內部的軍政權力則由藩主執掌。在所有大名中，與德川家有著血緣關係的被稱為「親藩」，自1600年關原之戰前便作為德川家臣追隨的被稱為「譜代」，而在關原之戰後才追隨德川家九九藏書的則被稱為「外樣」。

江戶幕府早期，德川家康曾通過與荷蘭建立正式的外交關係引進了不少歐式火炮，甚至還曾在圍攻大坂時下令國內鍛造所進行仿製，而家康的大坂圍攻戰又向全日本證明了歐式火炮在圍攻戰中的巨大作用，這種在日本遲遲沒有得到發展的武器似乎即將迎來自己的曙光。但到德川家光宣布鎖國之後，這種發展便完全陷入了停滯。甚至於200年後日本與外國爆發衝突時，日本軍隊仍然在使用火繩槍和老式火炮對抗以蒸汽為動力的西方戰艦。再加上幕府的海禁，戰船的發展也停滯在了戰國時代的水平。

幕府為削弱各藩軍隊實力而在1615年頒布《一國一城令》，各大名除自己的居城以外必須拆除所有城堡，甚至連殘垣斷瓦也不能留下。雖然大坂圍攻戰已經明確顯示了日式城池對於火炮而言已經相當脆弱了，但由於國內的和平，各藩也沒有再對城堡進行過多改進，只是普遍在原有基礎上進行擴大設計，儘可能使天守遠離對方火炮射程或僅僅是加固了天守結構，而自己在使用火炮進行防禦時依然無法發揚火炮威力。再加上即使是對城池進行修補也需要上報幕府批准，導致所有藩國在居城完工後便再無改進。

豐臣滅亡后，江戶幕府頒布了《武家諸法度》來對武士的行為以及大名的權力進行限制。而在那之前，家康還曾向朝廷強加了一份《公家諸法度》，將天皇以及公卿逐出了日本政治。這樣一來，幕府便成為了日本的唯一政治中心。到第三代將軍德川家光年間，幕府又繼續加強了對諸大名的控制，並將參覲交代等原先大名自發的非正式行為完全制度化，穩定了幕府統治基礎。

1614年，家康突然向豐臣家發難，聲稱其在方廣寺的鍾上銘文「君臣豐樂，國家安康」是在用將「家康」二字分開的方式來詛咒德川氏毀滅。在家康的一生中，其這次所尋找的借口可以算是最為牽強的一個，其原因便在於在秀賴上京參拜家康后德川家再難尋找更為合理的借口，而家康又壽命將盡，即使再為牽強，也只得抓住了。

在確保了自身的經濟優勢，並切斷豐臣氏的經濟來源之後，家康終於開始在政治方面施展權術。早在1600年關原會戰結束后不久，前田利家的遺孀、前田利長的母親春芳院阿松便被送往江戶居住，成為了家康控制前田家這一百萬石大名的人質。一年之後，伊達政宗又正式建議，諸大名均應將妻小送到江戶居住，就如同在豐臣政權下大名將妻小送到大坂一樣。1602年，細川忠興和加藤清正首先將人質送到了江戶，諸大名也隨即響應，紛紛在江戶建造宅邸，安頓自己的妻小，而這也成為了後來江戶幕府參覲交代制度的開端。