蘇曼殊去世后，友人蔡哲夫將其畫作彙編成冊付梓，由黃賓虹題籤「曼殊上人墨妙」。蔡去世后，曼殊遺畫原作由其夫人談月色珍藏，但至1948年被人從家中盜走。談月色說：「《蘇曼殊畫冊》被盜，輾轉流傳到香港。……被盜竊的原因是友人要我出讓這畫冊，願送我十億金圓券。我不欲出讓，想待將來有好人治國的時候送給國家保存。盜竊者知此情況，遂將此寶貴文物盜去。」曼殊遺畫的真跡至今下落不明，而當時的《蘇曼殊畫冊》由在廣東任督辦的李根源出資選印四百冊，僅發出幾十本，剩餘三百余本存於官舍中，毀於火災。

黃賓虹對友人說：「曼殊一生，只留下了幾十幅畫，可惜他早死了，但就是那幾十幅畫，其分量也夠抵得過我一輩子的多少幅畫！」

1914年，蘇曼殊的身體日漸孱弱，在東京rｅａｄ•９９csｗ.com入院治療。此時，他為友人（多為紅顏知己）索畫而苦惱，在給何震生的信中說：「和尚有愁無命，畫債如山。」他還編了一份名單，將舊日欠下畫債索畫者一一列入。

大同學校缺美術教員，便由蘇曼殊兼教美術課；梁啟超及其他教員編撰教科書，曼殊擔任了教科書插圖的繪畫工作。當時初等小學課本「山水日月」的插圖，大半出自曼殊之手。

蘇紹賢在《先叔蘇曼殊之少年時代》中寫道：「年甫五歲（應為六歲），先祖母黃氏及玉章祖舅攜歸廣東。在舟中時，曾向人索鉛筆及紙，繪一大舟，人取視之，則儼然已所乘之汽船也。眾以為異。其於四、五歲間，所繪各物，無一不肖，于繪畫天才，蓋具有夙根雲。」

《蘇曼殊圖像》的作者陳世強說：「曼殊作畫，筆墨極簡，往往『惜read.99csw.com墨如金』，以『偷工減料』的方式畫出，情景卻極其充實。」

高劍父說：「曼殊作畫都是送人的，愛用日本麻紙與絹，又從來不喜設色，畫的風格極其高遠。所以，後來有人說他『畫參中東之法，貫通融會，不甚著墨，而俊逸之氣，溢於楮表』。」

黃侃評蘇曼殊畫雲：「蘇子谷作畫，極蕭疏澹遠之致。」

陳獨秀評價蘇曼殊之畫道：「曼殊作畫，教人看了如咫尺千里，令人神往，不像庸俗畫匠之浪費筆墨。」

幼時，蘇曼殊便好塗鴉。四歲時，其母帶他到公園遊玩，曼殊被獅子所吸引，伏地繪獅子頻伸狀，栩栩欲活。

1905年，蘇曼殊隨好友劉季平至南京陸軍小學任美術教員。授課時，曼殊用鉛筆依次替學生在國畫紙上，繪出畫的輪廓，只寥寥數筆，惟妙傳神。

友人向蘇曼殊索畫，九九藏書曼殊從不肯輕易下筆。南社好友高吹萬千里寄縑，請曼殊繪製《寒隱圖》，一再稽延，頻年難以到手。《太平洋報》總編葉楚傖仰慕其祖上名媛葉小鸞，屢次請曼殊作《汾堤吊夢圖》，曼殊總以無凈室無畫具為由推脫。同在報社工作的李叔同在三樓有一工作室，布置精當，畫具一應俱全。一日，李叔同外出，葉在室內備好曼殊喜愛的糖果、雪茄、牛肉等，邀請曼殊入室品嘗。等曼殊一入室，葉即反鎖房門，並告訴他：「今天一定要畫完，畫不好不放你出來。」曼殊遂振筆作畫，一揮而就。葉楚傖於是打開房門，贈曼殊一豹褥，二人欣然共飲。

克士在《四極漫談》中記敘蘇曼殊繪畫之事：「友人某與曼殊素稱莫逆。一日，曼殊至其家，其子方八九歲，嬉皮頑臉，求曼殊為畫圖畫，取草紙一張，鋪敷桌面，復以大筆濡染九*九*藏*書墨汁而至，其勢似客非畫不可。曼殊乃為之濡墨筆，畫《葡萄》一幅，枝藤夭矯，垂實累累，墨氣滿紙，淋漓酣暢，以視吳昌碩作品，殆有過之。」

蘇曼殊曾繪《葬花圖》贈鄧以蟄，由陳獨秀跋詩云：「羅襪玉階前，東風楊柳煙。攜鋤何所事，雙燕語便便。」鄧將此畫視若拱璧，新中國后一直掛在其寓所的牆壁上，即使「文革」期間，畫作亦不離身。

蘇曼殊曾於日本收集並描畫出古代婦女的髮髻式樣凡一百種，稱《蓬瀛鬘史》（即《女子髮髻百圖》）。其中有些漢、唐的髮型，是他從日本圖書館所藏的古版書的插圖中描下來的。曼殊離開時，將《蓬瀛鬘史》贈與孫伯純。孫回憶：「民國前四五年……曼殊游東京淺草公園，園有觀音堂，村女子多來參拜。曼殊輒手一捲紙，在人叢中畫之，此捲成功，大約費時數歲之久，洵可寶也。ｒｅａｄ.９9cｓw•cｏm」

劉季平夫人陸靈素在《曼殊上人逸事》寫道：「上人偕粵東馬小進義士過華涇，在民元五月初。一夕飯罷，索胭脂作畫，時兒女輩皆已盡睡，外子覓得一片如薄餅者，置畫碟中。上人且畫且談笑，頃刻成《黃葉樓圖》一，為余畫扇面一。又蘸墨汁作橫幅一，筆端胭脂未凈，枯柳殘鴉，皆作紫醬色，今日尚儲篋中，成奇觀也。」

1898年，康有為的弟子徐勤、湯覺頓等在日本橫濱創辦大同學校，蘇曼殊即入此校就讀，其繪畫天才由此顯露。馮自由回憶：「曼殊在大同學校，對於文學，資質頗鈍，獨于畫學，則具有天才，在童年即以繪事為戲，絕無師承，而下筆似老畫家，同學莫不奇之。」后馮又在《蘇曼殊之真面目》中贊其「所作《陳元孝題壁》及《石翼王飲馬》二圖，老練精工，有同名宿，令人驚嘆不已，此才謂非出自天授不可也」。