1923年，因政府積欠經費九個月，北京八校教職員全體大會於同年11月9日議決：「必須10日拿到30萬元，不然就關門。」蔣夢麟回到北大后，召開全體教職員大會。蔣沉痛道：「如果主張關門，自無用說；若大家仍要維持，我雖則能力已盡，但是為著本校的維持，我仍舊願負這責任，雖生死以之可也。」蔣的堅韌感動了北大的教職員。最後，大會以「本校校務仍舊維持外，其他事件仍與各校以同情之合作」付諸表決，獲得通過。

蔣夢麟代理校長期間，內憂外患，經費短缺，困難重重。蔣一力擔當，鼓勵眾人：「至少也要維持北大的生命，決不讓他中斷。」

某日下午，一個日本憲兵找到蔣夢麟，說日本在東交民巷的駐防軍請他去一趟。蔣答應了，通知幾位朋友后，于天黑前孤身前往。他剛走進日本軍官的辦公室，便聽到門鎖咔嚓一聲鎖上了，旁邊一位軍官拔出手槍站在門口。這時，日本大佐高橋讓蔣夢麟坐下，讓蔣解釋為什麼進行大規模的反日宣傳。蔣申明，他並未進行反日宣傳，在反對日本自治運動的宣言上簽字是中國的內政問題。高橋接著問道：「那末你是日本的朋友嗎？」蔣答：「我是日本人民的朋友，但是也是日本軍國主義的敵人。」高橋讓蔣去大連，蔣明確表示https://read.99csw.com拒絕，從容說道：「我不是怕，如果我真的怕，我也不會單獨到這裏來了。如果你們要強迫我去，那就請便吧。不過我勸你們不要強迫我。如果全世界人士，包括東京在內，知道日本軍隊綁架了北京大學的校長，那你們可就要成為笑柄了。」高橋的臉色變了，只好送蔣夢麟出門，這時夜色已經四合。

幾日後，軍政部長給蔣夢麟發了一份公文。蔣夢麟記得內有蔣介石批示給軍政部長的話：「役政辦法如此腐敗，某之罪也。但該部所司何事，腐敗一至於此，可嘆可嘆。」可笑的是，軍政部的報告中竟說，某處患病壯丁，已送醫院治療；某處被狗吃過的壯丁屍體，已飭掩埋。蔣夢麟頗為憤怒，他後來回憶說：「這些話真是牛頭不對馬嘴，壯丁早已死了，而且那地方並無醫院，狗吃人肉早已吃完了，還要埋什麼呢？這真是『科員政治』的徹底表現了。」

蔣夢麟等人先行到達長沙，南開的張伯苓和清華的梅貽琦還沒有到。三校摩擦不斷，有人甚至說：「假使張、梅兩位校長不來，我們就拆夥好了。」蔣聲色俱厲地說道：「你們這種主張要不得，政府決定要辦一個臨時大學，是要把平津幾個重要的學府在後方繼續下去。我們既然來了，不管有什麼困https://read.99csw.com難，一定要辦起來，不能夠因為張伯苓先生不來，我們就不辦了。這樣一點決心沒有，還談什麼長期抗戰。」葉公超回憶：「我敢說，整個抗戰期間，在後方的高等教育沒有間斷，而能為國家繼續培養人才，蔣夢麟先生個人的貢獻是不可磨滅的。」

抗戰期間，蔣夢麟準備利用躲警報的時間寫《西潮》。但因為躲警報不是在郊外，就是在防空洞內，沒有桌椅等設備，經常是席地而坐，蔣夢麟決定用英文來寫。因為他覺得，寫中文需要鄭重其事，而寫英文可以閉起眼睛不加思索地畫下去，而且有時躲警報是在夜間，沒有燈光，寫作仍可繼續進行，只是寫到t與i，上面的一橫與一點，沒有辦法寫得準確。但寫完一章后，他感覺運用英文文字的技巧不能透徹表達他的思想，便暫時擱下寫作，開始熟讀英美有名作家的作品，如此經過了三年，再從頭寫起。此時他已經五十六歲。

晚年，夢麟再婚之事遭到許多友人的反對，陳誠對蔣夢麟說：「我的太太接到蔣夫人——第一夫人宋美齡的電話，她堅決反對你跟這位徐小姐結婚，我的太太也反對，都要我轉告於你。如果你一定要和她結婚，那麼我們以後不能見面了，至少，你的夫人我們是不能見面了。」

時在病中的胡適花費幾日九_九_藏_書時間，給蔣夢麟寫了一封長信，反對他再婚。胡適將信交給蔣夢麟時，蔣直接問胡適是支持還是反對，胡適回答反對，蔣說：「那我就不看了。」遂將胡適的這封信撕碎擲于廢紙簍中，后蔣夢麟秘書拾獲細心拼合，始恢複原狀，並得以保存於世。

年逾古稀的蔣夢麟開始學習日語，他每天利用從家到農復會上班路上的時間，背誦表侄宋越倫給他整理的500個基礎日語字集，並拜農復會一位台灣籍的低級職員為日語老師，每周花幾個小時上課。不到一年，他便可以無障礙地閱讀日文書報了。

蔣夢麟的身體一直不錯，雖然很瘦，可是他常對年輕人說：「你們年紀輕輕，不是頭疼，就是失眠。我呢，吃得下，倒下就睡。」他每年檢查身體，心臟猶如四十歲的人，有人說他是鶴形。但從1962年大腿骨折動手術后，一直沒有複原，常常感到疲倦。為了恢復得快，他天天騎固定的腳踏車，一天兩三次，練習腿勁，活動經脈。他說：「我這條老牛還可以耕幾年呢。」

30年代，陶希聖在北大任教六年，陶回憶：「蔣夢麟校長在這六年中間，未曾發過一次脾氣。自日本軍閥製造冀察特殊化之後，北大的處境之艱危，隨時有隨北平文化城覆滅之危險。蔣夢麟先生還是持身安靜，處事輕快。師生們的口號是『在北九九藏書平一天，當做二十年來做』。可以說，夢麟先生深得蔡先生的豁達的氣度，而融合的手腕過之。」

第二天，宋哲元派一位少將來勸蔣夢麟離開北平，蔣表示感謝，但他卻執意留下。羅家倫後來稱讚道：「在這般威嚇的情況之下，他仍能態度從容，而且指點敵人的愚蠢及其後果。唐郭子儀冕胄見回紇的情況，也不見得能超過這位文人！」

蔣夢麟在不知此事的處理結果前，因恐第一個報告起不了作用，又寫好第二份視察報告，準備再遞上去。這時，杜聿明得到某大員被捕的消息，通知他說：「你的報告已經發生效力，那位仁兄已被捕交給軍事法庭了。」蔣才把預備好的第二份報告燒了。

抗戰爆發后，蔣夢麟回鄉看望老父。離家重返南京時，蔣夢麟告訴父親：「中國將在火光血海中獲得新生。」父親目不轉睛地看著他：「你這是什麼意思？」蔣解釋道：「這次戰爭將是一次長期戰爭，千千萬萬的房屋將化為灰燼，千千萬萬的百姓將死於非命。這就是我所說的火光血海，最後中國將獲得勝利。」

1941年7月，蔣夢麟將擔任紅十字會會長期間考察的所見所聞，寫成《關於兵役狀況的視察報告》，親自送到軍事最高當局的收發室，並留了收條。之後久無消息，蔣夢麟便向陳布雷打聽。陳未曾聽說此事，便去查九*九*藏*書詢，才知道報告被擱置在秘書室里。蔣介石看后，帶了一名親信，親自到重慶某壯丁營調查，完全證實了蔣夢麟的報告。遂將主持役政的某大員交付軍事法庭審判。法庭經審理，判處該大員死刑。

1959年，時任北大校長的馬寅初在一片批判聲浪中堅決呼籲控制人口，而在海峽對岸，曾經的北大校長蔣夢麟也因提出節育人口的主張，遭立法委員及輿論的圍剿，甚至有「殺蔣夢麟以謝國人」之口號。蔣在記者招待會上公開表示：「我現在要積極地提倡節育運動，我已要求政府不要干涉我。如果一旦因我提倡節育而闖下亂子，我寧願政府來殺我的頭，那樣在太多的人口中，至少可以減少我這一個人！」

蔣夢麟說：「從童年時代起我就吃軟不吃硬。好好勸我，要我幹什麼都行，高壓手段可沒有用。」

蔣夢麟認為，結婚離婚都是個人的私事。他再婚時不聽從老朋友的勸告。後來發現自己錯了，又立即要分居，分居不成則堅決要求訴訟離婚。當時陳雪屏勸他不要打官司，一則打離婚官司必難速斷決了，二則以他這樣的高年與社會地位，必然成為轟動一時的社會新聞，對於他自己實在不利。蔣夢麟答道：「這是我個人的私事，我發覺錯誤便應改正，所謂『人作孽，不可救』，我願面對事實，接受不幸的後果。」遂堅決提起離婚訴訟。