1911年，趙爾豐接到任命，出任四川總督。他便和其推薦的新任川滇邊務大臣一道率兵繞道康北，一路將孔薩、白利、朱倭等土司繳印歸流。

前面講過，鹿傳霖任四川總督，派軍進擊瞻對藏軍得勝后，曾派委員張繼處理過德格土司家族內部爭奪土司權力而起的糾紛。當時，鹿傳霖有意在瞻對和德格實行改土歸流，便藉機將老土司切麥打比多吉夫婦和兩個兒子先解往打箭爐，再后又解往成都軟禁。鹿傳霖改土歸流未成，德格土司一家被釋放回本土。官方正史中對此事語焉不詳，但地方史料對此過程則有詳細描述。

川邊土司中也有攜帶印信號紙逃跑，以逃避改土歸流的。霍爾孔薩第七代土司擁金堪珠就以進藏朝佛為名，攜帶土司印信，率領屬下頭人喇嘛等共三百餘人，趁夜出逃。趙爾豐派兵追截，將其阻回，並於1911年3月，召開大會，公開收繳印信，宣布廢除世襲數代的土司權力。

民間傳說，昂翁降白仁青先是率敗兵逃到青海，經某寺著名活佛介紹，便和正返回拉薩的十三世達賴喇嘛一起到了西藏。他和其追隨者被噶廈政府安置在那曲地方，並給予四品職九*九*藏*書銜。

此時，德格土司家族內部不和，正好給趙爾豐一個插手的機會。

康南地方巴塘、里塘改土歸流初具成效。而康北的德格和霍爾五土司及明正土司等，還未著手進行。

公元1909年，清廷下旨，授予多吉僧格世襲都司職，保留二品頂戴花翎，每年發給膳銀三千兩。同時，將多吉僧格遷離德格，安置在巴塘。將巴塘前土司官寨和寨外馬場、水磨及菜園數畝和草場一片，歸其居住使用。也就是說，改土歸流，也不是一味將土司職權剝奪了事，朝廷還是要維持他們較高的地位與生活，地位由有品級的虛銜保證，生活嘛，就是給銀子和一定的生活資料。多吉僧格被遷往巴塘后，向趙爾豐興建的新學堂捐銀兩千兩，充作修建男女學堂的經費。為此，多吉僧格受到清廷褒獎，賞給一品頂戴和「急公好義」匾額一道。德格土司被廢，附近一些小土司無力抵抗，也相繼繳出印信，納地改流。趙爾豐便在這片地方設鄧柯府、德化州、麻隴州、石渠縣、同普縣。設置流官之外，又「集百姓議定賦稅，改善差徭」。

第一則：《趙和新任邊務大臣傅會九-九-藏-書銜札》：

「為會札事，照得各省土司地方，現經民政部稟請改流，奉旨允准咨行前來，自應欽遵辦理。本署督部堂大臣已將朱倭、白利、靈蔥、東科、孔薩、麻書六土司印信號紙一併收回，改設漢官管理。除孔薩、麻書兩土司因案革除不議外，其餘各土司擬稟請大皇上天恩，別給漢職世襲，永保其業。爾崇喜、曲登、毛丫各土司，應即將印信號紙呈繳來案，以便繳部銷毀，併為該土司稟請改為漢職，合行札飭。為此，札仰該土司遵照，札到之後，即將印信號紙剋期親帶，定於六月二十六日到打箭爐行轅呈繳，聽候分諭，勿得懷疑觀望，遲延干究。切切特札。」

這裏出現了一些前文未有的新土司名字。

鹿傳霖去職后，四川方面裁定，由切麥打比多吉的長子多吉僧格隨老土司「襄理政事，如能稱職，則准承襲」。不意切麥打比多吉夫婦在歸途中相繼病逝。經駐藏大臣文海審定，又經成都將軍恭壽允准，由多吉僧格代理土司職務，並頒給印信一枚。

嚴責之下，魚科土司也只好繳印了事。

「欽差大臣台前，小的魚科土司具懇稟事，情因小的自先年以來，不九*九*藏*書比他們牛廠，小的于大皇上屬下，每年上納銀子，大臣均是知道的，哀懇大臣准小的照前一樣居住，賞張執照，沾感不淺，如難允准，要繳印信號紙，懇先飭綽斯甲、革什咱兩土司呈繳印信后，小的亦隨即繳呈。」

趙爾豐平伏康南后，想在康北地區改土歸流，正愁無從著手，德格土司兄弟相爭誓不兩立，對他而言，正是天賜良機，當即親率大軍分多路自南向北挺進德格，多吉僧格也組織土兵八百余名以為內應。昂翁降白仁青兵敗逃往西藏。

趙當即在這稟文上批示：「稟悉。該土司懇求照前居住，賞給執照，均如所請。應繳印信號紙，乃奉旨之件，各處土司一律辦理，豈有綽斯甲、革什咱不令呈繳之理。惟爾懇求先飭該兩土司繳印之後始呈繳等情，定屬荒謬，同是繳印，何分先後？本督部大臣，豈有偏私，如朱倭、白利、靈蔥均已繳案，該土司何不以朱倭等比較，而以綽斯甲、革什咱為衡？似此野蠻無知，本應懲辦，姑從寬宥。」

我們以前說的都是互不隸屬的大土司或中土司。除此之外，還有一些小土司，清朝的土司制度，更多地狹民少的小土司是由大土司https://read.99csw.com管轄的。任乃強先生《康藏史地大綱》記清代川邊土司頗為詳盡。例如里塘宣撫司，就「外轄長官司三」，分別是瓦述毛丫長官司，瓦述曲登長官司和崇喜長官司。

《西康紀事詩本事注》載有趙爾豐改土歸流時的文書數件。

多吉僧格性情柔弱，繼承土司職后，大權落在了負責協理土司日常事務的大頭人手中。

他的同胞兄弟昂翁降白仁青則個性強悍。當年，在其母親和駐瞻對藏官的支持下，曾經實際控制過土司大權。其父不甘心大權旁落，清軍平瞻得勝后才有赴瞻對告狀之舉。有此前因，昂翁降白仁青對其兄承襲土司職位本就不滿，見其大權旁落，便用武力迫其兄退位。川省派章谷屯委員前往調解無果，多吉僧格被迫交出土司印信，逃往西藏出家為僧。時在1903年。昂翁降白仁青上任后，為擺脫忠於多吉僧格的大頭人的控制，另闢官寨居住行使土司權力。1906年正式呈請清廷，准許其正式承襲土司職位。駐瞻對藏官也派出武裝進駐德格，支持昂翁降白仁青。

魚科土司也是一個小土司，接到趙爾豐和新任邊務大臣傅華封的「會銜札」，不敢反抗也無力反抗，但還是試九_九_藏_書圖觀望拖延，便上了一個「夷稟」：

著者賀覺非說：「茲錄趙在邊文件數則於後，藉見改流情形之一斑。」我將此抄錄於此，想大家知道所謂「傳檄而定」是什麼意思。需要說明的是，這是在平巴塘、里塘、德格后的「傳檄而定」。

此時，多吉僧格走投無路，眼見在其兄弟相爭中，駐瞻對藏官並不站在自己一邊，而是明明白白地支持其弟弟，所以失敗后便不願也不敢再到西藏，剩下一條路便是從清廷方面得到支持。於是派親信南下巴塘，控告其弟反對「天命皇帝」，要求趙爾豐出兵鎮壓，並情願交出土司印信，在德格改土歸流。

戰後多吉僧格「多次要求呈繳印信號紙，自願辭去土司職務」，趙爾豐求之不得，自然允准。

此舉激起原多吉僧格手下任事頭人的激烈反對。他們派人從西藏迎回多吉僧格，同時組織武裝進攻昂翁降白仁青官寨。殺死和驅逐了部分支持昂翁降白仁青的頭人，多吉僧格重新執政，並將其弟囚禁。後來，昂翁降白仁青逃走。德格土司屬下頭人分成兩派，各擁一方，相互爭戰不止。最終，多吉僧格戰敗逃亡。昂翁降白仁青再次掌握土司大權。

趙爾豐在川邊的改土歸流，尚稱順利。